Aktualizace HALion 4.0.1 opravuje drobné problémy předešlé verze. Odstranit se podařilo problémy, které nastaly při deaktivaci jednotlivých MegaTrig modulů programu; dále problém, který se objevil při Undo na vloženém programu, který již byl přiřazen nějakému slotu. Aktualizován byl CoreAudio2MIDI, který řeší dřívější problémy s některými USB zařízeními. Byly také přidány chybějící presety reverbu REVerence a podařilo se vyřešit problém, který nastával při nastavení "Auto Visibility".